Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYT1P21579 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYT1P21579 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYT1P21579 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYT1P21579 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYT1P21579 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYT1P21579 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYT1P21579 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYT1P21579 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYT1P21579 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYT1P21579 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYT1P21579 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYT1P21579 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SYT1P21579 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYT1P21579 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYT1P21579 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYT1P21579 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYT1P21579 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYT1P21579 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SYT1P21579 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYT1P21579 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYT1P21579 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYT1P21579 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYT1P21579 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYT1P21579 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYT1P21579 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SYT1P21579 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYT1P21579 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYT1P21579 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYT1P21579 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SYT1P21579 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYT1P21579 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYT1P21579 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYT1P21579 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYT1P21579 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYT1P21579 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYT1P21579 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYT1P21579 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYT1P21579 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYT1P21579 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYT1P21579 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYT1P21579 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYT1P21579 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYT1P21579 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYT1P21579 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYT1P21579 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYT1P21579 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYT1P21579 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYT1P21579 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYT1P21579 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYT1P21579 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYT1P21579 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYT1P21579 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYT1P21579 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYT1P21579 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYT1P21579 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYT1P21579 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYT1P21579 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYT1P21579 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYT1P21579 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYT1P21579 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYT1P21579 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYT1P21579 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYT1P21579 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYT1P21579 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYT1P21579 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYT1P21579 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYT1P21579 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYT1P21579 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYT1P21579 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYT1P21579 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYT1P21579 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYT1P21579 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYT1P21579 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYT1P21579 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYT1P21579 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYT1P21579 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYT1P21579 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SYT1P21579 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT1P21579 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT1P21579 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT1P21579 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT1P21579 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT1P21579 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT1P21579 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT1P21579 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT1P21579 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYT1P21579 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms