Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB4P21439 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB4P21439 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB4P21439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCB4P21439 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB4P21439 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB4P21439 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB4P21439 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms