Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP6V1C1P21283 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6V1C1P21283 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP6V1C1P21283 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP6V1C1P21283 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP6V1C1P21283 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6V1C1P21283 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms