Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BdnfP21237 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BdnfP21237 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BdnfP21237 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BdnfP21237 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BdnfP21237 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BdnfP21237 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BdnfP21237 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BdnfP21237 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BdnfP21237 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BdnfP21237 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BdnfP21237 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BdnfP21237 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BdnfP21237 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BdnfP21237 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BdnfP21237 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BdnfP21237 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BdnfP21237 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BdnfP21237 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BdnfP21237 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BdnfP21237 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms