Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4BPBP20851 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4BPBP20851 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4BPBP20851 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4BPBP20851 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4BPBP20851 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4BPBP20851 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms