Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRM3P20309 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRM3P20309 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRM3P20309 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CHRM3P20309 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRM3P20309 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms