Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL3P19876 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL3P19876 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL3P19876 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL3P19876 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms