Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RXRAP19793 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RXRAP19793 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RXRAP19793 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RXRAP19793 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RXRAP19793 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RXRAP19793 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RXRAP19793 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RXRAP19793 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RXRAP19793 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RXRAP19793 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RXRAP19793 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RXRAP19793 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RXRAP19793 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RXRAP19793 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RXRAP19793 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RXRAP19793 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RXRAP19793 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RXRAP19793 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RXRAP19793 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RXRAP19793 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RXRAP19793 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RXRAP19793 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RXRAP19793 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RXRAP19793 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RXRAP19793 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RXRAP19793 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RXRAP19793 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RXRAP19793 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RXRAP19793 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RXRAP19793 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RXRAP19793 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RXRAP19793 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RXRAP19793 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RXRAP19793 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RXRAP19793 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RXRAP19793 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RXRAP19793 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RXRAP19793 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RXRAP19793 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RXRAP19793 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RXRAP19793 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RXRAP19793 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RXRAP19793 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RXRAP19793 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RXRAP19793 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RXRAP19793 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RXRAP19793 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RXRAP19793 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RXRAP19793 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RXRAP19793 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RXRAP19793 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RXRAP19793 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RXRAP19793 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RXRAP19793 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RXRAP19793 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RXRAP19793 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RXRAP19793 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RXRAP19793 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RXRAP19793 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RXRAP19793 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RXRAP19793 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RXRAP19793 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RXRAP19793 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RXRAP19793 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RXRAP19793 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RXRAP19793 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RXRAP19793 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RXRAP19793 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RXRAP19793 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RXRAP19793 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
RXRAP19793 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RXRAP19793 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RXRAP19793 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RXRAP19793 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RXRAP19793 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RXRAP19793 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RXRAP19793 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RXRAP19793 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RXRAP19793 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RXRAP19793 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RXRAP19793 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RXRAP19793 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RXRAP19793 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RXRAP19793 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RXRAP19793 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RXRAP19793 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RXRAP19793 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RXRAP19793 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RXRAP19793 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RXRAP19793 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RXRAP19793 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RXRAP19793 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RXRAP19793 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms