Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ms4a1P19437 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ms4a1P19437 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a1P19437 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ms4a1P19437 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a1P19437 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a1P19437 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a1P19437 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms