Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2CP19387 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2CP19387 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2CP19387 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2CP19387 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2CP19387 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2CP19387 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms