Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH2P19022 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH2P19022 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH2P19022 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH2P19022 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH2P19022 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH2P19022 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH2P19022 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH2P19022 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH2P19022 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH2P19022 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH2P19022 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH2P19022 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH2P19022 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH2P19022 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH2P19022 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH2P19022 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH2P19022 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH2P19022 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH2P19022 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH2P19022 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH2P19022 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH2P19022 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH2P19022 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH2P19022 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH2P19022 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH2P19022 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH2P19022 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH2P19022 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH2P19022 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH2P19022 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH2P19022 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH2P19022 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH2P19022 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH2P19022 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH2P19022 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH2P19022 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH2P19022 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH2P19022 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH2P19022 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH2P19022 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH2P19022 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH2P19022 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH2P19022 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH2P19022 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH2P19022 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH2P19022 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH2P19022 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH2P19022 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH2P19022 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH2P19022 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH2P19022 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH2P19022 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH2P19022 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH2P19022 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH2P19022 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH2P19022 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH2P19022 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH2P19022 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH2P19022 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH2P19022 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH2P19022 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH2P19022 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH2P19022 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH2P19022 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH2P19022 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH2P19022 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH2P19022 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH2P19022 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH2P19022 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH2P19022 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH2P19022 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH2P19022 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH2P19022 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH2P19022 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH2P19022 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH2P19022 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH2P19022 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH2P19022 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH2P19022 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH2P19022 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH2P19022 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH2P19022 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH2P19022 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH2P19022 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH2P19022 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH2P19022 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH2P19022 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH2P19022 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH2P19022 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH2P19022 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH2P19022 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH2P19022 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH2P19022 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH2P19022 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH2P19022 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH2P19022 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH2P19022 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH2P19022 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH2P19022 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms