Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR1P18146 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR1P18146 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR1P18146 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR1P18146 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR1P18146 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR1P18146 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR1P18146 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR1P18146 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR1P18146 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR1P18146 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR1P18146 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR1P18146 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EGR1P18146 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR1P18146 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR1P18146 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR1P18146 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR1P18146 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR1P18146 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR1P18146 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR1P18146 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR1P18146 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR1P18146 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR1P18146 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR1P18146 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR1P18146 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR1P18146 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR1P18146 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR1P18146 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR1P18146 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR1P18146 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR1P18146 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR1P18146 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR1P18146 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR1P18146 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR1P18146 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR1P18146 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR1P18146 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR1P18146 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR1P18146 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR1P18146 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR1P18146 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR1P18146 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR1P18146 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR1P18146 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR1P18146 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR1P18146 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR1P18146 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR1P18146 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR1P18146 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR1P18146 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR1P18146 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR1P18146 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR1P18146 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR1P18146 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR1P18146 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR1P18146 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR1P18146 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR1P18146 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR1P18146 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR1P18146 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR1P18146 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR1P18146 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR1P18146 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR1P18146 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR1P18146 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR1P18146 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR1P18146 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR1P18146 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR1P18146 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR1P18146 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGR1P18146 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGR1P18146 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR1P18146 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR1P18146 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR1P18146 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR1P18146 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR1P18146 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EGR1P18146 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR1P18146 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR1P18146 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR1P18146 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR1P18146 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR1P18146 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR1P18146 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR1P18146 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR1P18146 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR1P18146 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR1P18146 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR1P18146 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR1P18146 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR1P18146 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR1P18146 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR1P18146 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms