Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPI1P17947 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPI1P17947 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPI1P17947 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPI1P17947 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPI1P17947 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPI1P17947 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPI1P17947 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPI1P17947 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SPI1P17947 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPI1P17947 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPI1P17947 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPI1P17947 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPI1P17947 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPI1P17947 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPI1P17947 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPI1P17947 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPI1P17947 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPI1P17947 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPI1P17947 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPI1P17947 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPI1P17947 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPI1P17947 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPI1P17947 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPI1P17947 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPI1P17947 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPI1P17947 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPI1P17947 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPI1P17947 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPI1P17947 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPI1P17947 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPI1P17947 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPI1P17947 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPI1P17947 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPI1P17947 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPI1P17947 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPI1P17947 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPI1P17947 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPI1P17947 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPI1P17947 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPI1P17947 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPI1P17947 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPI1P17947 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPI1P17947 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPI1P17947 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPI1P17947 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPI1P17947 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPI1P17947 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPI1P17947 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPI1P17947 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPI1P17947 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPI1P17947 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPI1P17947 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPI1P17947 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPI1P17947 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPI1P17947 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPI1P17947 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPI1P17947 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPI1P17947 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPI1P17947 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPI1P17947 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPI1P17947 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPI1P17947 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPI1P17947 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPI1P17947 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPI1P17947 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPI1P17947 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPI1P17947 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPI1P17947 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPI1P17947 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPI1P17947 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPI1P17947 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPI1P17947 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPI1P17947 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPI1P17947 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPI1P17947 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPI1P17947 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPI1P17947 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPI1P17947 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPI1P17947 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPI1P17947 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPI1P17947 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPI1P17947 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPI1P17947 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPI1P17947 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPI1P17947 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPI1P17947 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPI1P17947 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPI1P17947 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPI1P17947 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPI1P17947 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPI1P17947 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPI1P17947 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPI1P17947 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPI1P17947 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPI1P17947 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPI1P17947 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPI1P17947 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPI1P17947 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPI1P17947 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms