Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTRB1P17538 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTRB1P17538 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTRB1P17538 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRB1P17538 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTRB1P17538 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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