Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spi1P17433 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spi1P17433 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spi1P17433 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spi1P17433 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spi1P17433 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spi1P17433 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spi1P17433 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spi1P17433 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Spi1P17433 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spi1P17433 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spi1P17433 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spi1P17433 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms