Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEP16870 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPEP16870 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEP16870 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPEP16870 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEP16870 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEP16870 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEP16870 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPEP16870 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPEP16870 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPEP16870 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEP16870 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEP16870 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEP16870 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEP16870 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEP16870 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEP16870 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEP16870 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEP16870 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEP16870 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEP16870 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPEP16870 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPEP16870 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPEP16870 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEP16870 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEP16870 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEP16870 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEP16870 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEP16870 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEP16870 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEP16870 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEP16870 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEP16870 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEP16870 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPEP16870 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPEP16870 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEP16870 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEP16870 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEP16870 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEP16870 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEP16870 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEP16870 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEP16870 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEP16870 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEP16870 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEP16870 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPEP16870 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEP16870 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEP16870 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEP16870 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEP16870 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEP16870 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPEP16870 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPEP16870 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEP16870 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEP16870 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEP16870 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEP16870 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEP16870 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEP16870 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEP16870 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEP16870 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEP16870 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEP16870 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEP16870 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEP16870 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEP16870 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEP16870 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEP16870 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEP16870 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEP16870 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEP16870 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEP16870 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEP16870 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEP16870 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPEP16870 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEP16870 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEP16870 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEP16870 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEP16870 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEP16870 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEP16870 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEP16870 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEP16870 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEP16870 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEP16870 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEP16870 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEP16870 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms