Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF3P15923 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF3P15923 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF3P15923 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCF3P15923 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCF3P15923 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF3P15923 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF3P15923 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF3P15923 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCF3P15923 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TCF3P15923 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCF3P15923 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TCF3P15923 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF3P15923 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF3P15923 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF3P15923 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF3P15923 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF3P15923 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF3P15923 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF3P15923 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF3P15923 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF3P15923 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF3P15923 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF3P15923 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF3P15923 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TCF3P15923 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCF3P15923 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF3P15923 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCF3P15923 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TCF3P15923 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF3P15923 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF3P15923 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF3P15923 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF3P15923 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF3P15923 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCF3P15923 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCF3P15923 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF3P15923 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF3P15923 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF3P15923 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF3P15923 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF3P15923 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF3P15923 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCF3P15923 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCF3P15923 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCF3P15923 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCF3P15923 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCF3P15923 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCF3P15923 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCF3P15923 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF3P15923 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF3P15923 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF3P15923 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF3P15923 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF3P15923 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF3P15923 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCF3P15923 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF3P15923 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCF3P15923 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TCF3P15923 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF3P15923 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF3P15923 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF3P15923 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCF3P15923 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCF3P15923 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCF3P15923 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCF3P15923 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCF3P15923 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF3P15923 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF3P15923 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF3P15923 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF3P15923 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF3P15923 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCF3P15923 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF3P15923 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF3P15923 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF3P15923 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF3P15923 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF3P15923 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF3P15923 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF3P15923 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCF3P15923 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms