Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
VEGFAP15692 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
VEGFAP15692 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VEGFAP15692 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VEGFAP15692 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
VEGFAP15692 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
VEGFAP15692 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VEGFAP15692 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
VEGFAP15692 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VEGFAP15692 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms