Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CPA1P15085 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CPA1P15085 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CPA1P15085 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CPA1P15085 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CPA1P15085 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPA1P15085 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPA1P15085 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPA1P15085 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CPA1P15085 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CPA1P15085 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CPA1P15085 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPA1P15085 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPA1P15085 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CPA1P15085 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CPA1P15085 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CPA1P15085 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CPA1P15085 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPA1P15085 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPA1P15085 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPA1P15085 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CPA1P15085 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPA1P15085 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPA1P15085 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CPA1P15085 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPA1P15085 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPA1P15085 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPA1P15085 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CPA1P15085 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CPA1P15085 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CPA1P15085 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CPA1P15085 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CPA1P15085 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CPA1P15085 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CPA1P15085 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPA1P15085 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPA1P15085 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPA1P15085 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CPA1P15085 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CPA1P15085 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPA1P15085 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPA1P15085 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPA1P15085 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPA1P15085 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPA1P15085 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CPA1P15085 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPA1P15085 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CPA1P15085 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPA1P15085 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPA1P15085 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPA1P15085 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPA1P15085 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPA1P15085 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPA1P15085 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPA1P15085 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPA1P15085 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPA1P15085 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPA1P15085 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPA1P15085 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPA1P15085 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPA1P15085 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPA1P15085 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPA1P15085 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPA1P15085 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPA1P15085 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPA1P15085 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPA1P15085 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPA1P15085 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPA1P15085 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPA1P15085 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CPA1P15085 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CPA1P15085 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CPA1P15085 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CPA1P15085 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CPA1P15085 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPA1P15085 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CPA1P15085 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CPA1P15085 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPA1P15085 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPA1P15085 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CPA1P15085 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CPA1P15085 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CPA1P15085 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CPA1P15085 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CPA1P15085 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CPA1P15085 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPA1P15085 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CPA1P15085 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CPA1P15085 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CPA1P15085 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPA1P15085 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPA1P15085 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPA1P15085 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPA1P15085 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CPA1P15085 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CPA1P15085 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CPA1P15085 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CPA1P15085 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CPA1P15085 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CPA1P15085 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms