Protein–RNA interactions for Protein: P14316

IRF2, Interferon regulatory factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF2P14316 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF2P14316 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF2P14316 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF2P14316 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF2P14316 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF2P14316 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF2P14316 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF2P14316 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF2P14316 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF2P14316 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF2P14316 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF2P14316 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF2P14316 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF2P14316 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF2P14316 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF2P14316 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF2P14316 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF2P14316 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF2P14316 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF2P14316 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF2P14316 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF2P14316 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF2P14316 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF2P14316 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF2P14316 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF2P14316 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF2P14316 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF2P14316 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF2P14316 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF2P14316 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF2P14316 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF2P14316 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF2P14316 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF2P14316 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF2P14316 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF2P14316 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF2P14316 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF2P14316 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF2P14316 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF2P14316 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF2P14316 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF2P14316 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF2P14316 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF2P14316 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF2P14316 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF2P14316 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF2P14316 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF2P14316 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF2P14316 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF2P14316 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF2P14316 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF2P14316 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF2P14316 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF2P14316 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF2P14316 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF2P14316 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF2P14316 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF2P14316 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF2P14316 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF2P14316 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF2P14316 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF2P14316 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF2P14316 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF2P14316 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF2P14316 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF2P14316 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF2P14316 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF2P14316 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF2P14316 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF2P14316 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF2P14316 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF2P14316 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF2P14316 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF2P14316 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF2P14316 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF2P14316 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF2P14316 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF2P14316 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF2P14316 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF2P14316 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF2P14316 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF2P14316 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF2P14316 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF2P14316 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF2P14316 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF2P14316 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF2P14316 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF2P14316 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF2P14316 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF2P14316 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF2P14316 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF2P14316 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF2P14316 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRF2P14316 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms