Protein–RNA interactions for Protein: P14220

Gypa, Glycophorin-A, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypaP14220 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GypaP14220 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GypaP14220 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GypaP14220 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypaP14220 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypaP14220 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypaP14220 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypaP14220 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GypaP14220 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GypaP14220 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GypaP14220 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypaP14220 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypaP14220 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypaP14220 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypaP14220 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypaP14220 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypaP14220 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GypaP14220 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GypaP14220 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypaP14220 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypaP14220 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypaP14220 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypaP14220 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GypaP14220 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GypaP14220 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GypaP14220 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GypaP14220 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GypaP14220 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GypaP14220 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GypaP14220 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GypaP14220 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GypaP14220 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GypaP14220 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GypaP14220 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GypaP14220 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GypaP14220 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GypaP14220 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GypaP14220 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GypaP14220 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GypaP14220 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GypaP14220 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GypaP14220 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GypaP14220 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GypaP14220 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GypaP14220 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GypaP14220 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GypaP14220 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GypaP14220 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GypaP14220 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GypaP14220 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GypaP14220 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypaP14220 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypaP14220 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypaP14220 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypaP14220 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypaP14220 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypaP14220 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypaP14220 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypaP14220 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypaP14220 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypaP14220 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypaP14220 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypaP14220 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypaP14220 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypaP14220 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypaP14220 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypaP14220 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypaP14220 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypaP14220 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GypaP14220 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GypaP14220 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypaP14220 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypaP14220 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypaP14220 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypaP14220 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypaP14220 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypaP14220 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypaP14220 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypaP14220 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypaP14220 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypaP14220 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypaP14220 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GypaP14220 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GypaP14220 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GypaP14220 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GypaP14220 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GypaP14220 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GypaP14220 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GypaP14220 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GypaP14220 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GypaP14220 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GypaP14220 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GypaP14220 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GypaP14220 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GypaP14220 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GypaP14220 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GypaP14220 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GypaP14220 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GypaP14220 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GypaP14220 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 467.2 ms