Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG2P13727 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG2P13727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG2P13727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG2P13727 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG2P13727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG2P13727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG2P13727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG2P13727 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG2P13727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG2P13727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG2P13727 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG2P13727 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG2P13727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG2P13727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG2P13727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG2P13727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG2P13727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG2P13727 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG2P13727 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG2P13727 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG2P13727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG2P13727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG2P13727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG2P13727 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG2P13727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG2P13727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG2P13727 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG2P13727 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG2P13727 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG2P13727 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG2P13727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG2P13727 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG2P13727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG2P13727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG2P13727 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG2P13727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG2P13727 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRG2P13727 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG2P13727 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG2P13727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG2P13727 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG2P13727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG2P13727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG2P13727 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG2P13727 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG2P13727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG2P13727 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG2P13727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG2P13727 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG2P13727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG2P13727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG2P13727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG2P13727 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG2P13727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG2P13727 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG2P13727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG2P13727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG2P13727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG2P13727 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG2P13727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG2P13727 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG2P13727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG2P13727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG2P13727 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG2P13727 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG2P13727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG2P13727 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG2P13727 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG2P13727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG2P13727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG2P13727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG2P13727 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG2P13727 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG2P13727 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG2P13727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG2P13727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG2P13727 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG2P13727 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG2P13727 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG2P13727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG2P13727 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG2P13727 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG2P13727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG2P13727 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG2P13727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG2P13727 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG2P13727 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG2P13727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG2P13727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG2P13727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG2P13727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG2P13727 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG2P13727 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms