Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN1P12814 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN1P12814 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ACTN1P12814 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACTN1P12814 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACTN1P12814 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ACTN1P12814 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN1P12814 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN1P12814 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms