Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa1P11477 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa1P11477 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa1P11477 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa1P11477 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa1P11477 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa1P11477 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa1P11477 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa1P11477 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa1P11477 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa1P11477 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms