Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNB1P11230 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNB1P11230 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNB1P11230 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNB1P11230 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHRNB1P11230 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNB1P11230 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms