Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl2P10148 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl2P10148 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccl2P10148 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccl2P10148 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl2P10148 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl2P10148 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms