Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBSLP0DN79 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBSLP0DN79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSLP0DN79 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSLP0DN79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSLP0DN79 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBSLP0DN79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBSLP0DN79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBSLP0DN79 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBSLP0DN79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBSLP0DN79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms