Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf89P0DMQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C8orf89P0DMQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf89P0DMQ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf89P0DMQ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf89P0DMQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms