Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSH2P0DML3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSH2P0DML3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSH2P0DML3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CSH2P0DML3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSH2P0DML3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSH2P0DML3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSH2P0DML3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSH2P0DML3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSH2P0DML3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CSH2P0DML3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSH2P0DML3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSH2P0DML3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSH2P0DML3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSH2P0DML3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSH2P0DML3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSH2P0DML3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CSH2P0DML3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSH2P0DML3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms