Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APELAP0DMC3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APELAP0DMC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APELAP0DMC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APELAP0DMC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms