Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA1P0DJI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA1P0DJI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAA1P0DJI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SAA1P0DJI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAA1P0DJI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms