Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC159P0C7I6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC159P0C7I6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC159P0C7I6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC159P0C7I6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC159P0C7I6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms