Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FREM3P0C091 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FREM3P0C091 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FREM3P0C091 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FREM3P0C091 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms