Protein–RNA interactions for Protein: P09813

Apoa2, Apolipoprotein A-II, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa2P09813 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apoa2P09813 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apoa2P09813 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoa2P09813 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa2P09813 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa2P09813 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa2P09813 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa2P09813 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms