Protein–RNA interactions for Protein: P08621

SNRNP70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70P08621 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRNP70P08621 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRNP70P08621 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRNP70P08621 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRNP70P08621 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRNP70P08621 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP70P08621 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRNP70P08621 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRNP70P08621 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRNP70P08621 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms