Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI1P08151 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI1P08151 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI1P08151 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GLI1P08151 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLI1P08151 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI1P08151 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI1P08151 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GLI1P08151 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GLI1P08151 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GLI1P08151 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GLI1P08151 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI1P08151 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI1P08151 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI1P08151 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GLI1P08151 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GLI1P08151 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GLI1P08151 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI1P08151 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI1P08151 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GLI1P08151 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI1P08151 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI1P08151 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI1P08151 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI1P08151 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI1P08151 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI1P08151 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI1P08151 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI1P08151 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI1P08151 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI1P08151 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI1P08151 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI1P08151 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI1P08151 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI1P08151 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI1P08151 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI1P08151 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI1P08151 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI1P08151 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI1P08151 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI1P08151 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI1P08151 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI1P08151 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI1P08151 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI1P08151 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI1P08151 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI1P08151 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI1P08151 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI1P08151 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI1P08151 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI1P08151 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI1P08151 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GLI1P08151 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI1P08151 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI1P08151 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI1P08151 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI1P08151 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI1P08151 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI1P08151 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI1P08151 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI1P08151 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI1P08151 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI1P08151 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI1P08151 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI1P08151 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI1P08151 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI1P08151 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI1P08151 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI1P08151 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI1P08151 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI1P08151 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI1P08151 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI1P08151 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI1P08151 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI1P08151 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI1P08151 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI1P08151 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI1P08151 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI1P08151 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLI1P08151 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI1P08151 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms