Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spta1P08032 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spta1P08032 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spta1P08032 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spta1P08032 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spta1P08032 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spta1P08032 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spta1P08032 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spta1P08032 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spta1P08032 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spta1P08032 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spta1P08032 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spta1P08032 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Spta1P08032 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms