Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms