Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTSLP07711 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTSLP07711 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTSLP07711 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSLP07711 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSLP07711 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSLP07711 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTSLP07711 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSLP07711 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSLP07711 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSLP07711 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSLP07711 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTSLP07711 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSLP07711 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSLP07711 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSLP07711 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSLP07711 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSLP07711 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSLP07711 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTSLP07711 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTSLP07711 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSLP07711 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSLP07711 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSLP07711 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSLP07711 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTSLP07711 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTSLP07711 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSLP07711 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSLP07711 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSLP07711 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTSLP07711 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTSLP07711 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTSLP07711 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTSLP07711 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSLP07711 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSLP07711 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSLP07711 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTSLP07711 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTSLP07711 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTSLP07711 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTSLP07711 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSLP07711 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSLP07711 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSLP07711 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSLP07711 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTSLP07711 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTSLP07711 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSLP07711 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSLP07711 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSLP07711 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSLP07711 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTSLP07711 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSLP07711 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTSLP07711 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTSLP07711 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTSLP07711 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTSLP07711 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTSLP07711 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSLP07711 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSLP07711 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTSLP07711 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTSLP07711 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTSLP07711 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSLP07711 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSLP07711 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSLP07711 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSLP07711 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSLP07711 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSLP07711 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTSLP07711 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTSLP07711 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTSLP07711 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTSLP07711 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSLP07711 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSLP07711 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSLP07711 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSLP07711 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSLP07711 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSLP07711 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSLP07711 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSLP07711 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSLP07711 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSLP07711 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSLP07711 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSLP07711 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTSLP07711 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSLP07711 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSLP07711 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSLP07711 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSLP07711 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTSLP07711 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSLP07711 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSLP07711 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSLP07711 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTSLP07711 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTSLP07711 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTSLP07711 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTSLP07711 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTSLP07711 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSLP07711 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms