Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SparcP07214 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SparcP07214 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SparcP07214 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SparcP07214 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SparcP07214 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SparcP07214 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SparcP07214 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SparcP07214 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SparcP07214 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SparcP07214 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SparcP07214 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SparcP07214 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SparcP07214 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SparcP07214 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SparcP07214 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SparcP07214 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SparcP07214 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SparcP07214 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SparcP07214 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SparcP07214 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SparcP07214 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SparcP07214 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SparcP07214 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SparcP07214 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SparcP07214 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SparcP07214 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SparcP07214 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SparcP07214 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SparcP07214 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SparcP07214 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
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SparcP07214 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SparcP07214 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SparcP07214 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SparcP07214 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SparcP07214 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SparcP07214 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SparcP07214 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SparcP07214 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SparcP07214 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SparcP07214 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SparcP07214 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SparcP07214 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SparcP07214 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SparcP07214 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SparcP07214 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SparcP07214 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SparcP07214 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SparcP07214 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SparcP07214 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SparcP07214 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SparcP07214 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SparcP07214 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SparcP07214 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SparcP07214 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SparcP07214 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SparcP07214 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SparcP07214 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SparcP07214 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SparcP07214 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SparcP07214 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SparcP07214 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SparcP07214 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SparcP07214 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SparcP07214 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SparcP07214 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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SparcP07214 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SparcP07214 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SparcP07214 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SparcP07214 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SparcP07214 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SparcP07214 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SparcP07214 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SparcP07214 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SparcP07214 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SparcP07214 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SparcP07214 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SparcP07214 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SparcP07214 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SparcP07214 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SparcP07214 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SparcP07214 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SparcP07214 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SparcP07214 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SparcP07214 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SparcP07214 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SparcP07214 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SparcP07214 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SparcP07214 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SparcP07214 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SparcP07214 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SparcP07214 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SparcP07214 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SparcP07214 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SparcP07214 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SparcP07214 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SparcP07214 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms