Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEFLP07196 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEFLP07196 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NEFLP07196 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEFLP07196 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFLP07196 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFLP07196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFLP07196 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEFLP07196 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEFLP07196 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEFLP07196 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEFLP07196 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEFLP07196 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEFLP07196 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NEFLP07196 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NEFLP07196 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NEFLP07196 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NEFLP07196 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEFLP07196 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEFLP07196 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NEFLP07196 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEFLP07196 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEFLP07196 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEFLP07196 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEFLP07196 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEFLP07196 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEFLP07196 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEFLP07196 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEFLP07196 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFLP07196 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEFLP07196 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEFLP07196 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEFLP07196 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFLP07196 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFLP07196 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFLP07196 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFLP07196 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFLP07196 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NEFLP07196 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFLP07196 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEFLP07196 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEFLP07196 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEFLP07196 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEFLP07196 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEFLP07196 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEFLP07196 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEFLP07196 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEFLP07196 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEFLP07196 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEFLP07196 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEFLP07196 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEFLP07196 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEFLP07196 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEFLP07196 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEFLP07196 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEFLP07196 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEFLP07196 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEFLP07196 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEFLP07196 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEFLP07196 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFLP07196 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFLP07196 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFLP07196 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFLP07196 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEFLP07196 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEFLP07196 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEFLP07196 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEFLP07196 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEFLP07196 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NEFLP07196 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEFLP07196 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEFLP07196 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEFLP07196 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEFLP07196 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEFLP07196 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFLP07196 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFLP07196 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFLP07196 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFLP07196 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFLP07196 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFLP07196 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEFLP07196 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEFLP07196 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEFLP07196 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEFLP07196 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEFLP07196 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEFLP07196 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEFLP07196 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEFLP07196 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEFLP07196 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFLP07196 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFLP07196 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFLP07196 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFLP07196 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms