Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGAVP06756 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAVP06756 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAVP06756 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGAVP06756 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAVP06756 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAVP06756 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAVP06756 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms