Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA4P06727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA4P06727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA4P06727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA4P06727 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA4P06727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA4P06727 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA4P06727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA4P06727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA4P06727 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA4P06727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA4P06727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOA4P06727 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA4P06727 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA4P06727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA4P06727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA4P06727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA4P06727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA4P06727 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA4P06727 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA4P06727 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA4P06727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA4P06727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA4P06727 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA4P06727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA4P06727 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA4P06727 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOA4P06727 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOA4P06727 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA4P06727 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA4P06727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA4P06727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA4P06727 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOA4P06727 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA4P06727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA4P06727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA4P06727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA4P06727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA4P06727 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA4P06727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA4P06727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA4P06727 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA4P06727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA4P06727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA4P06727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA4P06727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA4P06727 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA4P06727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA4P06727 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA4P06727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA4P06727 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA4P06727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA4P06727 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA4P06727 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA4P06727 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA4P06727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA4P06727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA4P06727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA4P06727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA4P06727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA4P06727 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA4P06727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA4P06727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA4P06727 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOA4P06727 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APOA4P06727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOA4P06727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOA4P06727 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA4P06727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA4P06727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA4P06727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA4P06727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA4P06727 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA4P06727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA4P06727 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA4P06727 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA4P06727 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA4P06727 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA4P06727 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA4P06727 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA4P06727 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA4P06727 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA4P06727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA4P06727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA4P06727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA4P06727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms