Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSNP06396 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSNP06396 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSNP06396 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSNP06396 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSNP06396 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSNP06396 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSNP06396 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSNP06396 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSNP06396 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSNP06396 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSNP06396 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSNP06396 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSNP06396 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GSNP06396 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSNP06396 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSNP06396 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSNP06396 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSNP06396 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSNP06396 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSNP06396 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSNP06396 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSNP06396 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSNP06396 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSNP06396 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSNP06396 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSNP06396 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GSNP06396 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSNP06396 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSNP06396 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSNP06396 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSNP06396 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSNP06396 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSNP06396 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSNP06396 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSNP06396 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSNP06396 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GSNP06396 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSNP06396 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSNP06396 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSNP06396 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSNP06396 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSNP06396 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSNP06396 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GSNP06396 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSNP06396 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSNP06396 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSNP06396 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSNP06396 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSNP06396 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSNP06396 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GSNP06396 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSNP06396 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GSNP06396 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSNP06396 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSNP06396 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSNP06396 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSNP06396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSNP06396 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSNP06396 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSNP06396 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSNP06396 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSNP06396 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSNP06396 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSNP06396 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSNP06396 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSNP06396 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSNP06396 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSNP06396 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSNP06396 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSNP06396 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSNP06396 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSNP06396 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSNP06396 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSNP06396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSNP06396 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSNP06396 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GSNP06396 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSNP06396 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSNP06396 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSNP06396 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSNP06396 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSNP06396 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSNP06396 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSNP06396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSNP06396 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSNP06396 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSNP06396 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSNP06396 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSNP06396 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSNP06396 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSNP06396 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSNP06396 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSNP06396 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSNP06396 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSNP06396 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSNP06396 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSNP06396 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSNP06396 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSNP06396 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms