Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV3-11P04433 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV3-11P04433 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGKV3-11P04433 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV3-11P04433 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-11P04433 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV3-11P04433 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms