Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrygdP04342 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CrygdP04342 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CrygdP04342 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrygdP04342 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CrygdP04342 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CrygdP04342 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrygdP04342 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CrygdP04342 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrygdP04342 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrygdP04342 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CrygdP04342 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrygdP04342 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrygdP04342 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrygdP04342 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrygdP04342 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms