Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRB1P04280 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRB1P04280 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRB1P04280 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRB1P04280 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRB1P04280 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRB1P04280 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRB1P04280 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRB1P04280 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRB1P04280 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRB1P04280 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRB1P04280 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRB1P04280 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRB1P04280 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRB1P04280 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRB1P04280 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRB1P04280 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRB1P04280 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRB1P04280 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRB1P04280 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRB1P04280 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRB1P04280 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRB1P04280 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRB1P04280 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRB1P04280 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRB1P04280 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRB1P04280 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRB1P04280 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRB1P04280 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRB1P04280 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRB1P04280 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRB1P04280 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRB1P04280 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRB1P04280 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRB1P04280 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRB1P04280 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRB1P04280 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRB1P04280 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRB1P04280 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRB1P04280 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRB1P04280 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRB1P04280 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRB1P04280 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRB1P04280 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRB1P04280 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRB1P04280 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRB1P04280 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRB1P04280 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRB1P04280 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRB1P04280 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRB1P04280 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRB1P04280 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRB1P04280 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRB1P04280 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRB1P04280 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRB1P04280 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRB1P04280 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRB1P04280 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRB1P04280 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRB1P04280 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRB1P04280 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRB1P04280 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRB1P04280 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRB1P04280 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRB1P04280 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRB1P04280 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRB1P04280 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRB1P04280 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRB1P04280 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRB1P04280 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRB1P04280 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRB1P04280 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRB1P04280 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRB1P04280 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRB1P04280 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRB1P04280 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRB1P04280 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRB1P04280 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRB1P04280 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRB1P04280 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRB1P04280 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRB1P04280 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRB1P04280 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRB1P04280 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRB1P04280 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRB1P04280 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRB1P04280 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRB1P04280 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRB1P04280 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRB1P04280 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRB1P04280 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRB1P04280 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRB1P04280 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRB1P04280 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRB1P04280 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRB1P04280 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRB1P04280 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRB1P04280 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRB1P04280 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRB1P04280 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms