Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3DP04234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3DP04234 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3DP04234 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD3DP04234 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD3DP04234 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD3DP04234 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD3DP04234 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3DP04234 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3DP04234 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3DP04234 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3DP04234 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3DP04234 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD3DP04234 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD3DP04234 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3DP04234 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3DP04234 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3DP04234 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3DP04234 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3DP04234 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3DP04234 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3DP04234 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD3DP04234 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD3DP04234 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD3DP04234 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD3DP04234 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD3DP04234 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD3DP04234 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD3DP04234 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3DP04234 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3DP04234 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3DP04234 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3DP04234 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3DP04234 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3DP04234 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3DP04234 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3DP04234 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3DP04234 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3DP04234 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3DP04234 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3DP04234 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3DP04234 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3DP04234 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3DP04234 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3DP04234 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3DP04234 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3DP04234 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3DP04234 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3DP04234 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3DP04234 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3DP04234 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3DP04234 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3DP04234 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3DP04234 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3DP04234 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3DP04234 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3DP04234 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3DP04234 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3DP04234 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3DP04234 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3DP04234 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3DP04234 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3DP04234 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3DP04234 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3DP04234 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3DP04234 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3DP04234 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3DP04234 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD3DP04234 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3DP04234 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3DP04234 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3DP04234 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3DP04234 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD3DP04234 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD3DP04234 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD3DP04234 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD3DP04234 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD3DP04234 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD3DP04234 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms