Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2P04141 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2P04141 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2P04141 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2P04141 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2P04141 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF2P04141 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2P04141 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2P04141 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2P04141 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF2P04141 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2P04141 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2P04141 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2P04141 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF2P04141 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF2P04141 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF2P04141 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF2P04141 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF2P04141 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF2P04141 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF2P04141 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF2P04141 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF2P04141 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF2P04141 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF2P04141 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF2P04141 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF2P04141 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF2P04141 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF2P04141 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF2P04141 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF2P04141 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF2P04141 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF2P04141 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF2P04141 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF2P04141 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF2P04141 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF2P04141 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF2P04141 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF2P04141 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF2P04141 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF2P04141 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF2P04141 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF2P04141 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF2P04141 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF2P04141 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSF2P04141 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF2P04141 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF2P04141 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF2P04141 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF2P04141 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF2P04141 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF2P04141 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF2P04141 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF2P04141 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF2P04141 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF2P04141 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF2P04141 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF2P04141 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF2P04141 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF2P04141 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF2P04141 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF2P04141 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF2P04141 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF2P04141 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF2P04141 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF2P04141 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF2P04141 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF2P04141 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF2P04141 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF2P04141 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF2P04141 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF2P04141 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF2P04141 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF2P04141 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF2P04141 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF2P04141 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF2P04141 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF2P04141 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF2P04141 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF2P04141 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSF2P04141 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSF2P04141 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms