Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01794 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01794 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01794 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01794 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01794 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P01794 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01794 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01794 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01794 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01794 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01794 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01794 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01794 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01794 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01794 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01794 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01794 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01794 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01794 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01794 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01794 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01794 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01794 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01794 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01794 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01794 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01794 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01794 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01794 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01794 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01794 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01794 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01794 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01794 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01794 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01794 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01794 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01794 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01794 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01794 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01794 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01794 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01794 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01794 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01794 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01794 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01794 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01794 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01794 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01794 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01794 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01794 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01794 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01794 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01794 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01794 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01794 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01794 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01794 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01794 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01794 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01794 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01794 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01794 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01794 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01794 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01794 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01794 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01794 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01794 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01794 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P01794 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01794 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01794 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01794 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01794 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01794 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01794 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01794 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01794 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01794 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01794 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01794 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01794 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms